在企業信息化的早期階段，企業經營管理的信息化與生產設備的自動化作為兩個獨立的模塊發展由于不同部門按照各自的目標建立自己獨立的信息系統以及當時環境的限制，阻礙了企業整體信息化的進程并導致以下問題的產生:
(1)信息孤島。信息孤島是指企業內部信息在水平方向上的斷裂。它是指在一個單位的各個部門之間由于種種原因造成部門與部門之間完全孤立,各種信息(如質量管理、設備維護、生產調度、過程控制等信息)無法或者無法順暢地在部門與部門之間流動。造成相互之間數據冗余、功能重疊等問題,從而嚴重影響企業內部各部門的協調性、阻礙了企業信息化的發展。
(2)信息斷層。信息斷層是指企業生產信息在垂直方向上的阻斷。由于客戶對產品要求的多樣化，勢必要求企業生產方式進行不斷的調整和更新。導致企業級的業務管理系統無法得到及時準確的實際生產信息，不能把握生產現場的真實情況，造成上層計劃的制定越來越困難，準確性和可行性難以得到保證。同時,由于生產現場人員與設備得不到切實可行的生產計劃與生產指示，使車間調度系統失去了它應有的作用。這種上下級的信息交流障礙信息斷層是公司內的經營管理系統與工廠級的生產管理系統不能整合的本質原因。
20世紀80年代中期以后，伴隨著客戶對產品需求的多樣性，企業的生產模式有大批量的剛性生產向多品種小批量的柔性生產轉變；同期由于計算機網絡和大型數據庫等信息技術的發展，企業的信息系統也由局部的、事后處理方式轉變為全局的、實時處理方式。在此期間，在管理系統軟件領域出現了從MRP(物料需求計劃)到MRPI(制造資源計劃)，直至ERP(企業資源計劃)系統的迅速普及；在過程控制領域PLC(可編程邏輯控制器)、DCS(分布式控制系統)得到廣泛的應用。
盡管企業信息化使得企業取得了一定的經濟效益。還有一個重要的環節被忽略了：上述管理系統主要是對企業的管理數據進行處理和運算，主要應用在計劃、預測、分析等方面，對企業生產過程的主體—生產現場管理卻沒有涉及到。這就造成了在計劃過程中得不到切實可行的作業計劃，車間管理人員無法跟蹤產品的生產過程,不能有效的控制在制品庫存。根本原因是在生產管理系統的計劃層和生產過程控制層之間存在一個信息流通上的斷層。
針對這種狀況，美國的調查咨詢公司AMR于1990年11月首次提出制造執行系統MES的概念,作為解決企業信息集成的解決方案。
